应正常办理离职手续后离职。当事人与用人单位发生纠纷，在职申请仲裁的，应在仲裁裁决后，执行完裁决决定，再正常移交工作，归还物品，办理离职手续。不可以擅自离职。
在职劳动者可以申请劳动仲裁。
第1、去当地人力资源和社会保障局（俗称劳动局）内设立的劳动争议仲裁委，申请劳动仲裁，立案时需携带：仲裁申请书2份、申请人身份证复印件1份；相关证据复印件和证据清单2份；用人单位的工商登记信息（北京地区等不需要提供登记信息）
第2、提交材料后，5个工作日仲裁委给予立案，然后给双方举证期并且给对方答辩期；然后开庭审理，之后对双方进行调解，调解不成仲裁委下达裁决书；劳动仲裁一般60天内结案；对于裁决书不服，劳动者收到裁决书15天内可以起诉到法院；第3、可以不请当地律师代理，请专业人士提供远程指导服务并代写劳动仲裁申请书、证据清单等法律文书。并且申请劳动仲裁期间，不耽误劳动者去新单位工作。
问劳动还未仲裁可以辞职吗？辞职不辞职是劳动者的权利，通常懂劳动法的人劳动还未仲裁是不会主动自己去辞职，若此时还没有仲裁先去辞职，那么对劳动者仲裁权利的维护会受到很大的影响，若劳动者自己去辞职那么首先仲裁中的经济补偿金或者经济赔偿金就会直接拿不到了，所以奉劝劳动还未仲裁前千万不要自己去辞职！
不可以。因为申请劳动仲裁只是为了解决与雇主之间的纠纷，仲裁结果并不代表你可以不上班。如果你不想上班，应该与雇主协商或者辞职。另外，如果你未经雇主同意擅自离职，则可能会面临违约赔偿，甚至会影响以后的就业。所以，申请劳动仲裁只是解决问题的方式之一，对于工作，我们还是应该遵守劳动法的规定，认真履行自己的职责。
申请劳动仲裁的员工不一定必须离职，如果还在合同期内，当然可以继续履行合同一直到期满为止。不过，实际情况是，一旦申请了仲裁，员工已经与公司拉破了脸皮，再继续呆在该公司，已经没有前途和发展，意义已不大。所以，不管仲裁结果是输还是赢，？申请仲裁的员工基本都会选择离职。
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