法院应合并审理双方当事人同时提起上诉的劳动争议纠纷案件，将双方当事人都列为上诉人。
当事人不服劳动争议纠纷案件一审法院判决，同时向二审法院提起上诉的，二审法院同时将双方列为上诉人，合并审理双方当事人同时提起上诉的案件，一并作出判决。
回答如下：如果双方都在仲裁后起诉，那么法院将会考虑仲裁裁决的内容和法律效力，并根据实际情况进行判决。
如果仲裁裁决已经被确认具有法律效力，那么法院将会对双方的起诉进行驳回。如果仲裁裁决尚未被确认，那么法院将会根据具体案件情况进行审理并作出判决。
1如果你在诉讼中同时提出撤销解除劳动合同，继续履行劳动合同的诉求及支付违法解除赔偿金的诉求的话，因为两个诉求是同一事实引起的不同的承担责任方式，而且互相冲突，所以不能合并审理。
2如果你在诉讼中直接变更诉讼请求为支付违法解除赔偿金的话，由于最高人民法院《关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释》第六条规定，当事人增加诉讼请求的，如合并审理，应以新增诉讼请求与诉争劳动争议具有不可分性为前提，而能否继续履行劳动合同与违法解除赔偿金是相互独立的，可能会以未经劳动仲裁前置驳回起诉。
3你所述情形应当是被驳回起诉后，又去劳动仲裁委员会申请劳动仲裁主张违法解除劳动合同赔偿金时被驳回，理由是前一个劳动争议案件一审被驳回起诉后，视为未对上一个劳动仲裁裁决提起诉讼，劳动仲裁裁决生效，该劳动仲裁裁决书关于解除劳动合同合法的裁决项生效。
3你正确的思路应当是，在第一个劳动争议案件中，不服仲裁裁决向法院起诉，仍主张继续履行劳动合同，如果法院在案件处理过程中发现确实无法继续履行劳动合同的，会向劳动者释明变更请求为要求用人单位支付违法解除劳动合同赔偿金等。至少北京和山东目前是这样做。
两个人一起申请劳动仲裁，仲裁机构应当作为两个独立的案件受理。如果两人的仲裁请求以及所依据的事实和理由一样并且被申请人一样，仲裁庭可以合并审理，一起作出裁定。可以单独宣判，也可以一起判；如果两个人的被申请人不一样，请求事项和事实、理由也不一样，应单独宣判。
仲裁案件适用合议庭程序需要满足以下条件：
1.仲裁协议中明确规定或当事人协商一致选择；
2.案件复杂或涉及法律问题较多；
3.当事人人数较多或各自代表的利益不同；
4.仲裁庭认为适用合议庭程序有助于解决案件。合议庭由多名仲裁员组成，共同审理并作出裁决，可以充分发挥多方专业知识和经验，提高裁决的准确性和公正性，适用于较为复杂的仲裁案件。
仲裁机构 中止仲裁 仲裁机构 中止仲裁的条件
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